MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Borrelia burgdorferi B31 plasmid cp32-6

Total Repeats: 691

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_000951	GT	3	6	66	71	0 %	50 %	50 %	0 %	11497225
2	NC_000951	AAAAC	2	10	81	90	80 %	0 %	0 %	20 %	11497225
3	NC_000951	T	6	6	135	140	0 %	100 %	0 %	0 %	11497225
4	NC_000951	AGA	2	6	164	169	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11497225
5	NC_000951	TGC	2	6	200	205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	11497225
6	NC_000951	TAT	2	6	272	277	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11497225
7	NC_000951	AAC	2	6	343	348	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	11497225
8	NC_000951	CAA	2	6	449	454	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	11497225
9	NC_000951	AT	3	6	504	509	50 %	50 %	0 %	0 %	11497225
10	NC_000951	ATTT	3	12	573	584	25 %	75 %	0 %	0 %	11497225
11	NC_000951	TAGAAA	2	12	598	609	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	11497225
12	NC_000951	T	6	6	629	634	0 %	100 %	0 %	0 %	11497225
13	NC_000951	CAA	2	6	685	690	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	11497225
14	NC_000951	CTT	2	6	691	696	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	11497225
15	NC_000951	AAT	2	6	717	722	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497225
16	NC_000951	TCT	2	6	744	749	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	11497225
17	NC_000951	T	6	6	749	754	0 %	100 %	0 %	0 %	11497225
18	NC_000951	AAT	2	6	855	860	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497225
19	NC_000951	TTA	2	6	904	909	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11497225
20	NC_000951	AGG	2	6	931	936	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	11497225
21	NC_000951	ATTA	2	8	944	951	50 %	50 %	0 %	0 %	11497225
22	NC_000951	ATG	2	6	1024	1029	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11497225
23	NC_000951	ATT	2	6	1048	1053	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11497225
24	NC_000951	GAA	2	6	1161	1166	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11497225
25	NC_000951	AG	4	8	1175	1182	50 %	0 %	50 %	0 %	11497225
26	NC_000951	TAA	2	6	1241	1246	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497225
27	NC_000951	GAG	2	6	1248	1253	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	11497225
28	NC_000951	ATT	2	6	1274	1279	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11497225
29	NC_000951	AGA	2	6	1317	1322	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11497226
30	NC_000951	AGA	2	6	1326	1331	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11497226
31	NC_000951	AGA	2	6	1350	1355	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11497226
32	NC_000951	GCA	2	6	1356	1361	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	11497226
33	NC_000951	GTTC	2	8	1677	1684	0 %	50 %	25 %	25 %	11497226
34	NC_000951	ATTAA	2	10	1780	1789	60 %	40 %	0 %	0 %	11497226
35	NC_000951	A	6	6	1791	1796	100 %	0 %	0 %	0 %	11497226
36	NC_000951	TTC	3	9	1809	1817	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	11497226
37	NC_000951	AGA	2	6	1854	1859	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11497226
38	NC_000951	AGA	2	6	2036	2041	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11497227
39	NC_000951	A	6	6	2049	2054	100 %	0 %	0 %	0 %	11497227
40	NC_000951	TAG	2	6	2171	2176	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11497227
41	NC_000951	ACA	2	6	2256	2261	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	11497227
42	NC_000951	TGG	3	9	2279	2287	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	11497227
43	NC_000951	TGGCA	2	10	2330	2339	20 %	20 %	40 %	20 %	11497227
44	NC_000951	AAATGG	2	12	2390	2401	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	11497227
45	NC_000951	TGCT	2	8	2530	2537	0 %	50 %	25 %	25 %	11497227
46	NC_000951	AATTA	2	10	2568	2577	60 %	40 %	0 %	0 %	11497227
47	NC_000951	TGA	2	6	2618	2623	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11497228
48	NC_000951	GAA	2	6	2694	2699	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11497228
49	NC_000951	A	6	6	2763	2768	100 %	0 %	0 %	0 %	11497228
50	NC_000951	TAG	2	6	2807	2812	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11497228
51	NC_000951	GTT	2	6	2821	2826	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	11497228
52	NC_000951	AGA	2	6	2891	2896	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11497228
53	NC_000951	TA	3	6	2966	2971	50 %	50 %	0 %	0 %	11497228
54	NC_000951	CTGATA	2	12	2986	2997	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	11497228
55	NC_000951	ATGT	2	8	3016	3023	25 %	50 %	25 %	0 %	11497228
56	NC_000951	TAG	2	6	3029	3034	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11497228
57	NC_000951	GTAT	2	8	3041	3048	25 %	50 %	25 %	0 %	11497228
58	NC_000951	ATAA	2	8	3123	3130	75 %	25 %	0 %	0 %	11497228
59	NC_000951	TTA	2	6	3139	3144	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11497228
60	NC_000951	TGG	3	9	3152	3160	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	11497228
61	NC_000951	CCA	2	6	3162	3167	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	11497228
62	NC_000951	TAAT	2	8	3172	3179	50 %	50 %	0 %	0 %	11497228
63	NC_000951	CT	3	6	3189	3194	0 %	50 %	0 %	50 %	11497228
64	NC_000951	CAAT	2	8	3205	3212	50 %	25 %	0 %	25 %	11497228
65	NC_000951	ATCAAG	2	12	3232	3243	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	11497228
66	NC_000951	TGG	2	6	3335	3340	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	11497228
67	NC_000951	AAGAG	2	10	3407	3416	60 %	0 %	40 %	0 %	364556497
68	NC_000951	T	6	6	3505	3510	0 %	100 %	0 %	0 %	364556497
69	NC_000951	ATC	2	6	3554	3559	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	364556497
70	NC_000951	TGG	2	6	3651	3656	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	364556497
71	NC_000951	GAT	2	6	3661	3666	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	364556497
72	NC_000951	AAT	2	6	3730	3735	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	364556497
73	NC_000951	TAG	2	6	3749	3754	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	364556497
74	NC_000951	TAA	2	6	3795	3800	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	364556497
75	NC_000951	CAC	2	6	3830	3835	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	364556497
76	NC_000951	TTTA	2	8	3896	3903	25 %	75 %	0 %	0 %	364556497
77	NC_000951	GTAA	2	8	3934	3941	50 %	25 %	25 %	0 %	364556497
78	NC_000951	ATT	2	6	3975	3980	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	364556495
79	NC_000951	TGA	2	6	3981	3986	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	364556495
80	NC_000951	ATT	2	6	3989	3994	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	364556495
81	NC_000951	TAA	2	6	4293	4298	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	364556495
82	NC_000951	TC	3	6	4313	4318	0 %	50 %	0 %	50 %	364556495
83	NC_000951	ATT	2	6	4345	4350	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	364556495
84	NC_000951	TTA	2	6	4355	4360	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	364556495
85	NC_000951	TTCAA	2	10	4386	4395	40 %	40 %	0 %	20 %	364556495
86	NC_000951	A	6	6	4404	4409	100 %	0 %	0 %	0 %	364556495
87	NC_000951	CTT	2	6	4441	4446	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	364556495
88	NC_000951	AGA	2	6	4467	4472	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	364556495
89	NC_000951	GTG	2	6	4481	4486	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	364556495
90	NC_000951	A	6	6	4514	4519	100 %	0 %	0 %	0 %	364556495
91	NC_000951	ATG	2	6	4570	4575	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	364556495
92	NC_000951	GCA	3	9	4621	4629	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	364556495
93	NC_000951	GCA	2	6	4636	4641	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	364556495
94	NC_000951	GGA	2	6	4659	4664	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	364556495
95	NC_000951	TAA	2	6	4692	4697	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	364556495
96	NC_000951	AGA	2	6	4701	4706	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	364556495
97	NC_000951	TTA	2	6	4772	4777	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	364556495
98	NC_000951	TCAT	2	8	4848	4855	25 %	50 %	0 %	25 %	364556495
99	NC_000951	AGG	2	6	4872	4877	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	364556495
100	NC_000951	CTA	2	6	4886	4891	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	364556495
101	NC_000951	A	7	7	4959	4965	100 %	0 %	0 %	0 %	11497216
102	NC_000951	GAA	3	9	4988	4996	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11497216
103	NC_000951	TTAC	2	8	5156	5163	25 %	50 %	0 %	25 %	11497216
104	NC_000951	GTT	2	6	5201	5206	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	11497216
105	NC_000951	GAATTT	2	12	5210	5221	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	11497216
106	NC_000951	A	6	6	5231	5236	100 %	0 %	0 %	0 %	11497216
107	NC_000951	TGAACT	2	12	5248	5259	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	11497216
108	NC_000951	ATT	2	6	5262	5267	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11497216
109	NC_000951	TAG	2	6	5272	5277	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11497216
110	NC_000951	GAA	2	6	5288	5293	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11497216
111	NC_000951	GGC	2	6	5294	5299	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	11497216
112	NC_000951	G	6	6	5302	5307	0 %	0 %	100 %	0 %	11497216
113	NC_000951	TG	3	6	5387	5392	0 %	50 %	50 %	0 %	11497216
114	NC_000951	AATG	2	8	5403	5410	50 %	25 %	25 %	0 %	11497216
115	NC_000951	TGT	2	6	5496	5501	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	364556496
116	NC_000951	TTC	2	6	5517	5522	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	364556496
117	NC_000951	AG	3	6	5528	5533	50 %	0 %	50 %	0 %	364556496
118	NC_000951	TTA	2	6	5570	5575	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	364556496
119	NC_000951	ATTTA	2	10	5702	5711	40 %	60 %	0 %	0 %	364556496
120	NC_000951	TGG	2	6	5819	5824	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	11497218
121	NC_000951	AT	3	6	5921	5926	50 %	50 %	0 %	0 %	11497218
122	NC_000951	AAT	2	6	5928	5933	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497218
123	NC_000951	TA	3	6	5937	5942	50 %	50 %	0 %	0 %	11497218
124	NC_000951	TAT	2	6	6022	6027	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11497218
125	NC_000951	TC	3	6	6037	6042	0 %	50 %	0 %	50 %	11497218
126	NC_000951	AAGT	2	8	6068	6075	50 %	25 %	25 %	0 %	11497218
127	NC_000951	GTA	2	6	6085	6090	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11497218
128	NC_000951	GCA	2	6	6096	6101	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	11497218
129	NC_000951	TTG	2	6	6109	6114	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	11497218
130	NC_000951	AAT	2	6	6236	6241	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497219
131	NC_000951	GCT	2	6	6296	6301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	11497219
132	NC_000951	ATA	2	6	6311	6316	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497219
133	NC_000951	AT	4	8	6413	6420	50 %	50 %	0 %	0 %	11497219
134	NC_000951	AT	3	6	6550	6555	50 %	50 %	0 %	0 %	11497219
135	NC_000951	TTA	2	6	6609	6614	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11497219
136	NC_000951	AGG	2	6	6696	6701	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	11497219
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274	NC_000951	AATCT	2	10	12272	12281	40 %	40 %	0 %	20 %	11497221
275	NC_000951	AAC	2	6	12331	12336	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	11497221
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287	NC_000951	TAA	2	6	12755	12760	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497194
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400	NC_000951	T	6	6	18025	18030	0 %	100 %	0 %	0 %	11497204
401	NC_000951	TTA	2	6	18091	18096	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11497204
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403	NC_000951	T	7	7	18133	18139	0 %	100 %	0 %	0 %	11497204
404	NC_000951	CTTG	2	8	18164	18171	0 %	50 %	25 %	25 %	11497204
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